Peptidnukleinsyre (PNA) er et kunstigt nukleinsyremolekyle, der har forskellige fordele i forhold til naturligt DNA og RNA, såsom høj selektivitet, stærk affinitet og stabilitet. Fastfasesyntese er en af hovedmetoderne til at syntetisere PNA med følgende specifikke trin:
Valg af passende beskyttelsesgrupper: Omsætning af beskyttelsesgrupperne med amino- eller carboxylgrupperne på PNA-precursoren for at danne estere eller amider af beskyttelsesgrupperne.
Forbindelse til polymerharpiks: PNA-precursoren modificeret med en beskyttende gruppe er forbundet til polymerharpiksen, typisk ved hjælp af en polymerharpiks med en kulstofkædelængde på 20-30 aminosyrerester.
Gentagelse af syntesecyklussen: inklusive fjernelse af den N-terminale beskyttelsesgruppe; Tilføj den næste aminosyreenhed; Udfør N-terminal beskyttelse igen.
Afbeskyttelse og adskillelse: Efter syntese løsnes PNA-peptidkæden fra polymerharpiksen gennem alkalisk behandling eller syrehydrolyse, og alle beskyttende grupper fjernes for at opnå PNA-produktet.
Denne metode kan effektivt syntetisere PNA-molekyler op til flere hundrede nukleotider i længden, og de syntetiserede produkter har høj renhed, hvilket gør dem velegnede til produktion i stor skala
I praktiske applikationer er renheden af PNA aggregeret af almindelige automatiske synthesizere imidlertid ikke ideel. HiPep Research Institute har udviklet en ny syntetisk metode, der kan give PNA-produkter med høj renhed. Denne metode løser nogle problemer i traditionel syntese, såsom dyre komponentpriser, let sterisk hindring af beskyttelsesgrupper og signifikant indvirkning af monomerens renhed på den biologiske aktivitet af mål-PNA. Standardsynteseområdet er 10-15 baser og for syntese på mere end 16 baser, er det en specialbestilling, der kræver særskilt kontakt med leverandøren
Derudover involverer PNA-syntese også forskellige modifikationsmetoder, såsom fluorescensmodifikation, biotinmodifikation, peptidmodifikation, glycosylering og DNA-modifikation, for at imødekomme forskellige forskningsbehov. Derfor er det meget vigtigt at vælge passende syntesemetoder og -teknikker baseret på specifik anvendelse scenarier og krav.
