Indflydelsen af opløsningsmidler på opløseligheden af peptider
Opløseligheden af peptider påvirkes af deres aminosyresammensætning. Hydrofobe aminosyrer, såsom leucin (leu), isoleucin (ILE) og valin (Val), gør peptider hydrofobe, mens hydrofile aminosyrer såsom lysin (Lys), histidin (hans), arginin (arg) gør peptider hydrofile. Derfor har forskellige peptider forskellig opløselighed på grund af deres sammensætningsforskelle.
Effekten af opløsningsmidler på peptidstabilitet
Deamidationsreaktion
I deamidationsreaktionen danner hydrolysen af asparagin (ASN) og glutamin (GLN) rester asparaginsyre (ASP) og glutaminsyre (GLU). Disse reaktioner kan påvirke stabiliteten af peptider.
Oxidation
Peptidopløsninger er tilbøjelige til oxidation, hvilket kan skyldes peroxidforurening i opløsningen eller spontan oxidation af selve peptidet. Oxidation påvirker ikke kun strukturen af peptider, men kan også føre til deres tab af funktion.
Hydrolyse
Peptidbindinger i peptider hydrolyseres og ødelægges, især dem, der er dannet af ASP.
Disulfidbindingsformationsfejl
Udveksling mellem disulfidbindinger eller mellem disulfidbindinger og thiolgrupper kan resultere i dannelse af forkerte disulfidbindinger, hvilket fører til ændringer i tertiær struktur og tab af aktivitet.
Racemisk reaktion
Bortset fra glycin (GLY) er alfa -carbonatomerne af alle aminosyrerester chirale og tilbøjelige til racemiseringsreaktioner under alkalisk katalyse. Blandt dem er rester af asparaginsyre (ASP) mest tilbøjelige til racemiseringsreaktioner.
- eliminering
- Eliminering henviser til eliminering af funktionelle grupper på carbonatomet i aminosyrerester. Denne reaktion forekommer mere sandsynligt ved alkalisk pH, og temperatur- og metalioner har også indflydelse på det.
Opløs peptider i miljøvenlige opløsningsmidler
Ved opløsning af peptider kan en lille mængde n - methylpyrrolidon (DMF) eller dimethylsulfoxid (DMSO) bruges til at hjælpe med opløsning. Disse to opløsningsmidler kan fremme opløsning ved at forstyrre den sekundære struktur af peptider. Det skal dog bemærkes, at disse opløsningsmidler kan forstyrre den biologiske aktivitet af peptider og efterfølgende forskningsarbejde, så der skal udvises forsigtighed, når man bruger dem.
Konklusion
Sammenfattende kan miljøvenlige opløsningsmidler såsom DMF og DMSO hjælpe med at opløse peptider ved at forstyrre deres sekundære struktur, men deres anvendelse kan have indflydelse på strukturen og den biologiske aktivitet af peptider. Derfor, når man vælger og bruger miljøvenlige opløsningsmidler, er det nødvendigt at veje deres indflydelse på peptidstruktur og opløselighed for at sikre stabilitet og biologisk aktivitet af peptider.